Его история начинается с 1996 года, когда после распада СССР из-за разрастания межнациональных и межэтнических конфликтов для борьбы с набирающим силы и масштаб терроризмом, как и во многих других регионах России, в Алтайском крае назрела необходимость создания мобильного, высокопрофессионального, боеспособного антитеррористического подразделения.
Действующий состав подразделения – это отлично подготовленные профессионалы, обладающие выдержкой и крепким внутренним стержнем. Командировки в "горячие точки" для участия в спецоперациях стали привычными. А повседневная работа на территории Алтайского края связана с задержанием лиц, причастных или подозреваемых в причастности к терроризму, нелегальному наркобизнесу, коррупции, контрабанде оружия и взрывчатых веществ.
Только за последние пять лет сотрудниками антитеррористического подразделения проведено около 100 оперативно-боевых мероприятий, задержано 136 граждан, подозреваемых в совершении тяжких и особо тяжких преступлений, изъято
Среди наград, которых сотрудники подразделения удостоены за мужество и отвагу, проявленные при выполнении спецзаданий, - орден Мужества, медали "За заслуги перед Отечеством", "За отвагу", Суворова, Жукова, медаль ФСБ Российской Федерации "За участие в контртеррористической операции".